La siguiente es la cronología de los hechos en las causas contra los integrantes de la Triple A, por crímenes de lesa humanidad, y contra Isabel Martínez de Perón, por la desaparición de dos personas en Mendoza durante su mandato.
-2 de noviembre 2006: el juez federal de San Rafael, Mendoza, Héctor Acosta, comenzó a investigar a la ex presidenta María Estela Martínez de Perón y a sus ex ministros, Antonio Cafiero y Carlos Ruckauf, en una causa por desaparecidos, a raíz de la firma de tres decretos en 1975 que ordenaban "aniquilar el accionar de los elementos subversivos".
-3 de noviembre de 2006: el juez Acosta se negó a confirmar si había solicitado la detención de la ex presidenta y se excusó en el secreto sumarial, aunque admitió que ordenó la investigación de "un montón de personas".
-7 de noviembre: el abogado José Bibiano Cedrún Gutiérrez presentó ante el Consejo de la Magistratura un pedido de remoción contra el juez Acosta con el argumento de que el letrado habría ordenado la detención de la ex presidenta y dos de sus ministros sólo para "adquirir notoriedad".
-9 de noviembre 2006: el juez Acosta hizo lugar al pedido de exención de prisión del ex ministro Antonio Cafiero y solicitó una fianza de 200.000 pesos que fue apelada por el apoderado legal del ex senador por considerarla excesiva.
-19 de diciembre de 2006: Revelan que en la ciudad de Valencia vive el ex subcomisario Rodolfo Almirón, un ex jefe de la Triple A y jefe de la custodia de Perón y López Rega.
-20 de diciembre 2006: La Justicia federal envió un informe a Interpol de España recordándole que desde 1984 en la Argentina existe un pedido de captura contra Almirón.
-21 de diciembre 2006: El Movimiento Argentinos en el Exterior, que lidera Lois Pérez Leira, presentó al juez Baltazar Garzón y al ministerio del Interior de España un pedido formal de detención de Almirón.
-26 de diciembre: el juez Oyarbide declaró delitos de lesa humanidad imprescriptibles a los crímenes cometidos por la Triple A y ordenó la captura internacional de Almirón. -27 de diciembre 2006: Oyarbide no descartó la convocatoria de Isabel Perón, por la causa de los desaparecidos en Mendoza.
-28 de diciembre 2006: La policía española arrestó en la provincia de Valencia a Almirón. -5 de enero 2007: el abogado español José Angel Pérez Nievas denunció que Almirón participó en acciones de la ultraderecha española e italiana.
-8 de enero 2007: Juan Ramón Morales, ex policía y uno de los jefes operativos de la Triple A, quedó bajo arresto domiciliario en Buenos Aires, tras ser indagado por Oyarbide. -9 de enero 2006: Oyarbide afirmó que existía la posibilidad de citar a declarar a la ex presidenta y sus dos ministros, Ruckauf y Cafiero.
-10 de enero 2007: Atilio Neira, uno de los abogados de la ex presidenta, insistió en desvincularla de las acusaciones respecto a la desaparición de dos ciudadanos mendocinos.
-11 de enero 2007: el juez Acosta solicitó a Interpol la captura y detención de María Estela Martínez de Perón para que declare en la causa sobre la desaparición de Héctor Aldo Faggetti Gallego, secuestrado en 1976 durante el mandato de la ex presidenta, y de un menor.
-12 de enero 2007: Miguel Angel Rovira, ex policía sindicado como uno de los asesinos de Julio Troxler -ex subjefe de la Policía bonaerense durante el gobierno de Héctor Cámpora en 1973-, fue detenido hoy con arresto domiciliario, luego del pedido de captura que hizo Oyarbide. Además, otro implicado en la causa, Felipe Romeo, también con pedido de captura, habría sido ubicado en Londres por efectivos de Interpol.
-12 de enero 2007: La ex presidenta fue detenida en Villanueva de la Cañada, localidad madrileña, en España.