ウイルスハンター：自分を「COVIDのフォレストガンプ」と呼ぶ有名なウイルス学者のしくみ

エドワード・ホームズは、タヌキの黒い目が鉄の檻の棒を通して彼を見ているのを見るとすぐに、その瞬間を捉えなければならないことを知りました。2014年10月でした。シドニー大学の生物学者であるホームズは、新しいタイプのウイルスについて何百もの動物種を研究するために中国を訪れました。

人口1100万人のショッピングモール、武漢を訪れた際、市内の疾病予防管理センターの科学者が彼を華南卸売水産市場に連れて行きました。息苦しい空間の屋台で、生きた野生動物（ヘビ、アナグマ、マスクラット、鳥）が食料として売られているのを見た。しかし、現実を捉えるために携帯電話を取り出したのはタヌキでした。

ウイルスの進化に関する世界の専門家の一人として、ホームズはウイルスがどのようにしてある種から別の種へと飛び移り、時には致命的な結果をもたらすかについて深く理解していました。2002年のSARSの大流行は、中国で発生したコウモリコロナウイルスが原因で、人間に感染する前にある種の野生哺乳類に感染しました。主な容疑者の中には、中間動物、アライグマ犬がいます。

「起こりそうな病気の発症について、これ以上の教科書の例を得ることはできませんでした」 とホームズ（57）はインタビューで述べた。イギリス人は、足の長いアライグマのように見えるが、キツネとより密接に関係しているアライグマの写真を撮ったとき、注目を集めないように最善を尽くしました。その後、彼は自分のケージに入っている他の動物の写真をさらにいくつか撮りました。セールスマンが生き物の1つを殴り始めたとき、彼は自分の電話をポケットに入れて逃げました。または、少なくともこれは、ニューヨークタイムズが科学の特別なプロファイルの一部として発行したスペシャリストのプロファイルが保証するものです。

2019年の最終日まで、写真は彼の心から消えていった。シドニーの自宅からツイッターをサーフィンしているときに、彼女は武漢での驚くべき大発生について知りました。 SARSのような肺炎で、初期の症例は華南市場に関連しています。「タヌキ」と彼は思った。

「それはパンデミックが起こるのを待っていて、それが起こった」と彼は言った。その日から、彼はウイルスの起源に関する発見と論争の旋風に引き込まれ、 「コロナウイルスのフォレストガンプ」のように感じさせられ、冗談を言った。

彼と中国人の同僚は、新型コロナウイルスのゲノムを世界で初めて共有しました。その後、病原体がコウモリコロナウイルスからどのように進化したかについての重要な手がかりを発見しました。

そして、ウイルスが武漢の研究所から漏洩した可能性があるかどうかについての論争の的となっている地政学的議論の中で、ホームズは反対の理論、つまりウイルスが野生動物からこぼれたという最も強力な支持者の1人になりました。彼は最近、米国の同僚とともに、 2014年に撮影したのと同じ鉄のケージにアライグマ犬を飼っていたことがパンデミックの引き金になった可能性があるという魅力的な手がかりを発表しました。

このスペシャリストのCOVID-19研究は、オーストラリアで最も重要な科学賞を含め、国際的に高い評価を得ています。しかし、彼はまた、彼の調査がソーシャルメディアへの攻撃の洪水、さらには死の脅威とともに、中国軍によって監督されていたという主張も受けています。すべてにもかかわらず、ホームズはコロナウイルスに関する研究の急流を発表し続けています。彼の長年の同僚は、不安定な時代における彼の絶え間ない生産は、優れた科学チームを結成する並外れた能力と、物議を醸す議論に没頭する意欲に起因すると考えています。

MITのブロードインスティテュートとハーバード大学の遺伝学者であるPardis Sabeti氏は、「彼はオープンマインドで、関与し、考えることができ、防御的ではないため、適切な種類の考え方を持つ適切な人物です」と語った。一方、アメリカの研究者で心臓専門医であり遺伝学者であるMedscapeの現在の編集長であるエリック・トポルは、ホームズに対するツイッター・アカウントで、「彼は自分を「コロナウイルスのフォレスト・ガンプ」と呼んでいる。

ウイルスのハンティング

ホームズは類人猿と人間の進化を研究し、その後ウイルスに転向した。30年間、エジンバラ、オックスフォード、ペンシルベニア州、そしてついにシドニーで働き、ホームズは600以上の記事を出版してきました。HIV、インフルエンザ、エボラなどのウイルスの進化について。

2012年にシドニー大学に招待されたとき、彼はこの機会を利用してアジアにアプローチし、野生生物の取引が新たなパンデミックを引き起こすのではないかと懸念していました。ペンシルバニア州立大学の進化生物学者、アンドリュー・リードは、「彼は火のあるところへ行く」と語った。

引っ越しの準備をしている間、ホームズは中国のウイルス学者Yong-Zhen Zhangから予期せぬメールを受け取り、中国で彼と一緒にウイルスを研究したいかどうか尋ねました。彼らのコラボレーションは急速に拡大し、何百もの動物種における新しいウイルスの根本的な探索へと発展しました。彼らは小屋の壁から引き裂かれたクモと南シナ海から採取された魚を研究しました。

最後に、彼らは2000種以上の科学に新しいウイルスを発見し、その中には多くの驚きがありました。科学者たちは、インフルエンザウイルスは主に鳥類に感染し、私たちのような哺乳類に感染する可能性があると考えていました。しかし、ホームズとチャンは、魚やカエルもインフルエンザにかかることを発見しました。エジンバラ大学の進化生物学者で、調査に参加しなかったアンドリュー・ランボー氏は、「それはかなり明らかでした」と語った。「存在するウイルスの多様性は膨大です」

2014年の偵察旅行の1つで、2人の専門家は武漢疾病予防管理センターの科学者と協力して、周辺の湖北省の動物を研究しました。CDCの科学者たちは、野生生物取引の心配事例を見るために、彼らを華南市場に連れて行きました。訪問後、ホームズは彼と彼の同僚が動物調査のために開発した遺伝子配列決定技術を使用して、市場に出ている動物に含まれるウイルスを探すことができることを望んでいました。しかし、彼の同僚は、病気の人々のウイルスを探すことにもっと興味を持っていました。

それで、張と一緒に、彼は武漢中央病院の医師と協力し始め、肺炎の人々からの肺液のサンプルからウイルスRNAを探し始めました。この連携により、2014年から2020年にかけて、中国疾病予防管理センターの客員教授に任命されました。ホームズ氏らは先月、2016年と2017年に採取された408人の患者のサンプルを基に、このプロジェクトに関する最初の報告書を発表した。多くの人が複数のウイルスに感染しており、一部は細菌や真菌に感染していることが判明しました。研究者らは、隠れた発生の証拠を見た。6人の患者が遺伝的に同一のエンテロウイルスに感染した。研究者たちはまた、中国全土の土壌、堆積物、動物の糞を調べて、ウイルス圏の研究を続けました。しかし、2019年12月の終わりに、その作業は中止されました。

新型コロナウイルスの到来

張博士は武漢の新しい肺炎について聞いたとき、武漢中央病院の同僚に患者から肺液を送るように頼んだ。彼は1月3日に到着し、彼とホームズが完成させた技術を使用してウイルスを検索しました。2日後、彼のチームは新しいコロナウイルスSARS-CoV-2のゲノムを収集しました。中国の他の科学チームもウイルスのシーケンスを行っていました。しかし、中国政府は科学者がそれに関する情報を公表することを禁止していたので、誰もそれを公表しなかった。

張とホームズは、ゲノムに関する記事を書き始めました。ゲノムは、後にネイチャー誌に掲載されます。張は禁止令をあざけり、米国国立衛生研究所がホストする公開データベースにウイルスゲノムをアップロードしたが、長いレビューが必要だったため、情報がオンラインで公開されずに数日かかった。ホームズは共同研究者にゲノムを世界と共有する別の方法を見つけるよう促した。「それは起こらなければならなかったようだった」と彼は言った。

1月10日、彼らはウイルス学者のためのフォーラムでそれを共有することに同意し、ホームズはそれをオンラインにしました。テキサス大学オースティン校の構造生物学者であるジェイソン・マクレラン氏によると、モデルナワクチンを駆動するmRNA技術に取り組んだのは、その決定がターニングポイントでした。その遺伝子配列によってのみ、研究者は検査、薬物、ワクチンに取り組み始めることができます。それまで、マクレランによれば、彼のような科学者たちは、スターティングブロックのランナーのようで、スターティングガンを待っていました。「エドワードとヨンジェンがゲノム配列を発表した瞬間、それは急上昇した」 と彼は述べた。「すぐにツイッターが盛り上がり、メールがやりとりされ、レースが始まった」

しかし、中国のメディア報道によると、張は自国の情報禁止に異議を唱えたことで代償を払った。ゲノム配列決定が実施された翌日、上海公衆衛生臨床センターの彼の研究室は、それを「修正」するために閉鎖するよう命じられました。その後、張はネイチャーの記者に、この動きは罰ではなく、彼の研究室は後に再開することを主張した。ニューヨークタイムズの記事にコメントする専門家への電子メール要求は答えられなかった。そしてホームズは張博士の現在の状況についてコメントすることを拒否した。

コロナウイルスのゲノムを配列決定した後、ホームズは遺伝子工学によってそこに置かれたように見える遺伝物質のいくつかの断片を見て困惑しました。2020年2月1日の電話会議で、科学者はNIHのフランシス・コリンズ博士や米国の感染症の第一人者であるアンソニー・S・フォーチなど、他のウイルス専門家と懸念を共有しました。他の科学者たちは、ゲノムのこれらの特性は、ウイルスの自然な進化によって簡単に発生した可能性があると呼びかけで説明しました。

その後すぐに、ホームズは香港大学の研究者が、センザンコウに見られるコロナウイルスを分析するのを助けました。 SARS-CoV-2 に関連します。このウイルスは、ウイルスが細胞に侵入するために使用するピコと呼ばれる表面タンパク質が特に似ていました。野生動物ウイルスからこのような異なる生物学的特徴を発見したことで、SARS-CoV-2は遺伝子工学の産物ではないという専門家の信頼が強まりました。「突然、奇妙に思えることは明らかに自然なことだ」 と彼は強調した。

ホームズと彼の同僚は、2020年3月に発行された書簡でこれらの発見のいくつかを述べた。その同じ月、彼は張博士と書いたコメントで、華南市場でケージに入れられた動物の写真をいくつか公開し、動物が流出した可能性があることを示唆しています。しかし、ウイルスが実験室で設計されたという考えは引き続き勢いを増し、ウイルス学者は中国の科学者との研究に襲われました。

2020年5月、オーストラリアの新聞The Daily Telegraphは、「赤軍がコロナウイルスの研究をどのように監督したか」というタイトルの記事で、中国軍とリンクしました。この論文は、センザンコウの研究に携わった2人の科学者が中国の軍事研究所と二次的提携を結んでいたという事実に基づいて主張している。科学者に会ったことはないと言ったホームズは、彼らがセンザンコウ組織からRNAを配列決定するのを助けたと述べた。

シドニー大学は、専門家を代表して次のように述べています。「私たちは、研究者が協力する権利を強く擁護します。関連するすべてのオーストラリア政府の法律とガイドラインに従って、世界中の科学者」.大学は、専門家の研究はオーストラリアの助成金によって完全に資金提供されていると指摘しました。

2020年の終わりに、世界保健機関は新しいコロナウイルスの起源を調査するために中国への専門家グループ旅行を組織しました。ホームズは2014年のマーケット写真を彼らに送ったが、彼らはWHOのレポートに届かなかった。「中国代表団の一部のメンバーは、私がそれらの画像を作成できたかもしれないと提案しました」とホームズは警告しました（EcoHealth Allianceの社長でWHOレポートの研究者の一人であるPeter Daszakはこのアカウントを裏付けました）。中国の研究者は、写真は「検証できない」と述べた。改ざんされた可能性があります」とDaszakは言いました）。

今後の流出防止

先月発表されたレポートでは、ホームズと30人以上の共同研究者がCOVID-19の最初の症例を分析し、それらが市場にクラスター化されていることを発見し、最初のコロナウイルスサンプルの突然変異を調べました。オックスフォード大学の野生生物生物学者で、この研究の共著者であるクリス・ニューマン氏は、彼の中国人の同僚は、2019年後半に華南市場でいくつかの野生哺乳類が販売されているのを見たと語った。専門家によると、それらのいずれかがパンデミックの原因であった可能性があります。「アライグマ犬はまだ検査できないが、確かに疑わしい」 と彼は言った。

一部の批評家は、Huananの動物が原因であるとホームズ博士と彼の同僚がどれほど確実であるかを疑問視しています。新型コロナウイルスの最初の症例の多くは市場に関連していましたが、他の肺炎症例はまだCOVID-19の初期症例として認識されていない可能性があります。キングス・カレッジ・ロンドンのバイオセーフティの専門家であるフィリッパ・レンツォスは、「最初の症例についてはまだほとんどわかっていません。最終的な結論を引き出すために、おそらく私たちが知らない別の症例があるでしょう」と説明しました。「私は、自然の間接的な影響と研究関連の起源の両方にオープンであり続けています。」

別の問題：感染した動物が本当にパンデミックを起こした場合、それらは決して見つかりません。2020年1月、中国のCDCの研究者が調査のために市場に到着したとき、すべての動物がいなくなった。しかし、ホームズは、動物市場が別のパンデミックを引き起こす可能性があるという十分な証拠があると主張しています。先月、彼と彼の中国人の同僚は、野生または繁殖農場で調達された市場でしばしば販売される18種の動物の研究を発表しました。「彼らは完全にウイルスでいっぱいだった」と彼は言った。

いくつかの潜在的なヒト病原体を含む、脊椎動物に感染する100を超えるウイルスが明らかになりました。そして、これらのウイルスのいくつかは最近、種の障壁を飛び越えました。アナグマに感染する鳥インフルエンザ、アライグマに感染する犬のコロナウイルスです。一部の動物は人間のウイルスに感染していました。

将来のパンデミックの可能性を減らす最も簡単な方法は、このような研究を人間と生命の野生。新しいウイルスを発見した彼自身の経験は、野生生物の潜在的な脅威をすべてカタログ化しようとしても意味がないことを彼に確信させました。「存在するすべてのウイルスをテストして、どれが人間に感染する可能性があるかを判断することはできませんでした。それが実現可能だとは思わない」と彼は言った。

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