病毒猎人:自称 “COVID阿甘正传” 的著名病毒学家如何运作

爱德华·霍尔姆斯对该病毒的研究为他赢得了国际赞誉,包括澳大利亚最高科学奖。2014年,他访问了武汉市场,并预计 “疫情即将发生”

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爱德华·霍尔姆斯一看见浣熊狗的黑眼睛透过铁笼的铁栏看着他,他就知道自己必须抓住这一刻。那是 2014 年 10 月。悉尼大学的生物学家@@ 福尔摩斯曾前往中国研究数百种动物物种以寻找新型病毒

武汉是一个拥有 1100 万人口的购物中心,在访问武汉时,该市疾病控制与预防中心的科学家将他带到了华南海鲜批发市场。在闷热的空间里一个又一个的摊位里,他看到活的野生动物(蛇、獾、麝香鼠、鸟)被出售作为食物。但是正是浣熊狗让他拿出手机来捕捉现实。

作为世界上病毒进化的专家之一,福尔摩斯对病毒如何从一种物种跳到另一种物种有着深刻的了解有时会带来致命的后果。2002 年 SARS 疫情是由中国的一种蝙蝠冠状病毒引起的,该蝙蝠冠状病毒在感染人类之前感染了某种类型的野生哺乳动物。在主要嫌疑人中,有一种中间动物:浣熊狗。

57岁的福尔摩斯在接受采访时说:“关于即将发生的疾病的发作,你再也没有比这更好的教科书例子了。”这位英国人在拍摄浣熊狗的照片时尽了最大努力不引起人们的注意,浣熊狗看起来像长腿浣熊,但与狐狸的关系更为密切。然后,他又在自己的笼子里拍了几张其他动物的照片。当推销员开始殴打其中一个生物时,他把手机放在口袋里然后逃跑了。或者至少这是《纽约时报》作为其特别《科学概况》的一部分而发表的专家简介所保证的。

直到@@ 2019年的最后一天,这些照片才从他的脑海中消失。悉尼在家中浏览 Twitter 时,她得知武汉爆发了一场令人震惊的疫情:类似SARS的肺炎,早期病例与华南市场有关。他想:“浣熊狗。”

他说:“这是一场等待发生的疫情,然后发生了。”他开玩笑说,从那天起,他就陷入了与病毒起源有关的发现和争议的旋风这使他觉得自己像是 “冠状病毒的阿甘正传”

爱德华·霍尔姆斯认为,市场上的浣熊犬可能引发了冠状病毒大流行(来源:埃迪·霍尔姆斯)
爱德华·霍尔姆斯认为,市场上的浣熊犬可能引发了冠状病毒大流行(来源:埃迪·霍尔姆斯)

他和一位中国同事是第一个与世界分享新型冠状病毒基因组的人然后,他发现了有关病原体可能是如何从蝙蝠冠状病毒演变而来的关键线索。

在关于该病毒是否可能从武汉实验室泄漏的有争议的地缘政治辩论中,福尔摩斯已成为相反理论的最有力支持者之一:病毒是从野生动物身上溢出来他最近与美国的同事一起发表了一些诱人的线索,表明浣熊狗被关在2014年拍摄的同一个铁笼里可能引发了疫情。

这位专家的 COVID-19 研究为他赢得了国际赞誉,包括澳大利亚最重要的科学奖他还收到声称,他的调查受到中国军方的监督,以及对社交媒体的大量攻击,甚至死亡威胁。尽管如此,福尔摩斯仍在继续发表大量有关冠状病毒的研究。他的长期同事将他在不稳定时期的持续生产归因于组建优秀科学团队的非凡能力以及愿意沉浸在有争议的辩论中。

麻省理工学院布罗德研究所和哈佛大学的遗传学家帕迪斯·萨贝蒂说:“他是心态正确的正确人,因为他可以思想开放、参与和思考,而不是防御。”同时,现任 Medscape 主编的美国研究人员、心脏病专家和遗传学家埃里克·托波尔(Eric Topol)在他针对福尔摩斯的 Twitter 帐户上指出:“他称自己为'冠状病毒的阿甘正传',此而已。”

寻找病毒

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在关于该病毒是否可能从武汉实验室泄漏的有争议的地缘政治辩论中,福尔摩斯已成为对立理论的最强支持者之一:该病毒是从野生动物身上溢出来的(路透社)

福尔摩斯研究了类和人类的进化,然后转向病毒。三十年来,福尔摩斯在爱丁堡、牛津、宾夕法尼亚以及最后在悉尼工作,发表了 600多篇文章 包括艾滋病毒、流感和埃博拉病毒在内的病毒的演变。

2012年,当他受邀进入悉尼大学时,他借此机会进入了亚,他担心野生动植物贸易可能引发新的疫情宾夕法尼亚州立大学的进化生物学家安德鲁· 雷德说:“他去了火灾所在的地方,” 当时正在和他一起工作的进化生物学家安德鲁·雷德说。

在准备此举时,福尔摩斯收到了一位名叫张永振的中国病毒学家的意外电子邮件,询问他是否愿意和他一起在中国研究病毒。他们的合作迅速扩展到在数百种动物物种中彻底寻找新病毒。他们研究了从小屋墙上撕下的蜘蛛和从南中国海捕获的鱼。

最后,他们发现了 2000多种科学界的新病毒,其中有很多惊喜。例如,科学家曾经认为,流感病毒主要感染鸟类,然后它们可以将它们传播给像我们这样的哺乳动物。但是福尔摩斯和张发现鱼和青蛙也会感染流感爱丁堡大学的进化生物学家安德鲁·兰博特说:“这很有启发性,” 他没有参加调查。“存在的病毒的多样性是巨大的。”

在 2014 年的一次侦察旅行中,两位专家与武汉疾病预防控制中心的科学家合作,研究湖北省周边地区的动物。疾病预防控制中心的科学家将他们带到华南市场,看看令人担忧的野生动植物贸易案例。访问结束后,福尔摩斯希望他和他的同事们能够利用他们在动物调查中开发的基因测序技术来寻找市场上动物体内的病毒。但是他的同事们对在病人身上寻找病毒更感兴趣。

因此,他与一起开始与武汉市中心医院的医生合作,在肺炎患者的肺液样本中寻找病毒RNA。由于这次合作,他于2014年至2020年被任命为中国疾病预防控制中心的客座教授。上个月,福尔摩斯和他的同事们根据2016年和2017年收集的 408名患者的样本发布了该项目的第一份报告。事实证明,许多人感染了一种以上的病毒,有些人还感染了细菌或真菌。研究人员甚至看到了隐性疫情的证据:六名患者感染了基因相同的肠道病毒。研究人员还继续研究病毒圈研究来自中国各地的土壤、沉积物和动物粪便。但是到了2019年12月底,这项工作停止了。

COVID-19 的到来

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张和福尔摩斯是组装SARS-CoV-2基因组的人。尽管中国的其他科学团队也对该病毒进行了测序,但没有人将其公开,因为中国政府禁止科学家发布有关该病毒的信息(Getty Images)

医生听说武汉出现了新的肺炎时,他要求武汉市中心医院的同事给他送肺液。他于 1 月 3 日抵达,使用他和福尔摩斯完善的技术来搜索病毒。两天后,他的团队组装了一种新的冠状病毒SARS-CoV-2的基因组。中国的其他科学团队也对该病毒进行了测序。但是他们都没有公开,因为中国政府禁止科学家发布有关它的信息。

福尔摩斯开始写一篇关于基因组的文章后来发表在《自然》杂志上嘲笑这项禁令,并将病毒基因组上传到美国国立卫生研究院托管的公共数据库,需要进行长时间的审查,因此花了几天时间才在网上发布信息。福尔摩斯敦促他的合作者找到另一种与世界分享基因组的方法。他说:“看来必须发生。”

1月10日,他们同意在病毒学家论坛上分享它福尔摩斯将其发布网上。德克萨斯大学奥斯汀分校的结构生物学家杰森·麦克莱伦表示,这一决定是一个转折点,他研究了驱动 M oderna 疫苗的 mRNA 技术。只有有了这个基因序列,研究人员才能开始研究测试、药物和疫苗。根据麦克莱伦的说法,在此之前,像他这样的科学家就像起跑者一样,在等待起跑枪。他说:“当爱德华和永振公布基因组序列的那一刻,它就飙升了。”Twitter 立刻充满了兴奋,交换了电子邮件,比赛开始了。”

据中国媒体报道,为挑战该国的信息禁令付出了代价。基因组测序实施后的第二天,他在上海公共卫生临床中心的实验室被命令关闭,以 “纠正” 它后来,张向《自然》记者坚持说,此举不是惩罚,他的实验室后来重新开放。向专家发出的对《纽约时报》报道发表评论的电子邮件请求没有得到答复。福尔摩斯拒绝对博士的现状发表评论。

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福尔摩斯帮助香港大学的研究人员分析了在穿山甲中发现的与SARS-CoV-2密切相关的冠状病毒。该病毒的表面蛋白 pico 特别相似,该病毒用来进入细胞(Europa Press)

在@@ 对冠状病毒基因组进行测序后,福尔摩斯困惑地看到一些遗传物质片段似乎是通过基因工程放置在那里的。在 2020年2月1日的电话会议上,这位科学家与其他病毒专家分享了他的担忧,包括美国国立卫生研究院院弗朗西斯·柯林斯博士和美国传染病领先专家安东尼·福西。其他科学家在电话会议中解释说,基因组的这些特征很容易通过病毒的自然进化而产生。

不久之后,福尔摩斯帮助香港大学的研究人员分析了在穿山甲中发现的一种冠状病毒 该冠状病毒与与 SARS-CoV-2 有关。该病毒的表面蛋白(称为微微)特别相似,该病毒用来进入细胞。在@@ 野生动物病毒中发现如此不同的生物特征增强了专家的信心,即 SARS-CoV-2不是基因工程的产物他强调说:“突然之间,看起来奇怪的事情显然是自然的。”

福尔摩斯和他的同事在 2020年3月发表的一封信中阐述了其中的一些发现同月,他在与博士撰写的一评论中公布了他在华南市场的一些笼中动物的照片,暗示那里可能是动物泄漏的地点。但是,关于该病毒是在实验室中设计的想法继续受到关注,这位病毒学家因与中国科学家的合作而受到攻击。

2020年5月,澳大利亚报纸《每日电讯报》发表了一篇题为 “红军如何监督冠状病毒研究” 的文章,将其与中国军方联系起来。该论文的主张基于这样一个事实,即两名参与穿山甲研究的科学家与中国军事实验室有次要关系。福尔摩斯说他从未见过科学家,他指出,他们帮助从穿山甲组织中测序了RNA。

悉尼大学代表该专家发表声明:“我们坚决捍卫研究人员与之合作的权利根据澳大利亚政府的所有相关法律和准则,向世界各地的科学家提供帮助”。该大学指出,该专家的研究完全由澳大利亚的补助金资助。

2020年底,世界卫生组织组织了一次专家组赴中国考察新型冠状病毒的起源。福尔摩斯向他们发送了他2014年的市场照片,但他们从未出现在世卫组织的报告中。福尔摩斯警告说:“中国代表团的一些成员建议我本来可以拍出这些照片,”(生态健康联盟主席、世卫组织报告中的一位研究人员彼得·达扎克证实了这一说法:中国研究人员说,这些照片 “无法核实”而且可能是伪造的,” 达扎克说)。

防止将来发生泄漏

中国动物冠状病毒
福尔摩斯认为,有足够的证据表明动物市场可能导致另一场疫情(法新社)

在上个月发布的报告中,福尔摩斯和30多位合作者分析了第一例 COVID-19 病例,发现它们聚集在市场上,并检查了第一批冠状病毒样本中的突变。牛津大学野生动物生物学家、其中一项研究的合著者克里斯·纽曼说,他的中国同事在2019年底看到几种野生哺乳动物在华南市场出售。根据专家@@ 的说法,他们中的任何一个都可能对疫情负责。他说:“浣熊狗还不能接受测试,但它们肯定是可疑的。”

一些批评家质疑福尔摩斯博士及其同事如何确定华南的动物是罪魁祸首。尽管许多首批新的冠状病毒病例都与市场有关,但其他肺炎病例可能尚未被确认为早期的 COVID-19 病例。伦敦国王学院生物安全专家菲利帕·伦佐斯(Filippa Lentzos)解释说:“我们对第一批病例知之甚少,可能还有其他我们不知道的病例无法得出最终结论。”“我仍然对自然间接影响和与研究相关的起源持开放态度。”

另一个问题:如果受感染的动物真的开始了疫情,它们将永远无法被发现。2020年1月,当中国疾病预防控制中心的研究人员到达市场进行调查时,所有动物都消失了。福尔摩斯认为,有足够的证据表明动物市场可能导致另一场疫情。上个月,他和他的中国同事发表了一项针对18种动物的研究报告,这些动物通常在市场上出售,这些动物来自野外或繁殖场。他说:“他们绝对充满了病毒。”

100多种感染脊椎动物的病毒曝光,其中包括几种潜在的人类病原体。其中一些病毒最近突破了物种的屏障:感染獾的禽流感,感染浣熊狗的犬冠状病毒。其中一些动物还感染了人类病毒。

他认为 ,降低未来疫情可能性的最简单方法是在两者之间的界面进行这样的研究人类和生命狂野他自己在发现新病毒方面的经验使他相信,试图对野生动物的所有潜在威胁进行分类是没有意义的。“你永远无法测试所有存在的病毒,然后确定其中哪些病毒可以感染人类。我认为这不可行,” 他说。

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